Laboratoř charakterizace molekulární struktury
Vedoucí laboratoře:
prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Tel: (+420) 241 062 786
E-mail: vlhavlic@biomed.cas.cz
Webové stránky laboratoře (v angličtině)
| prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr. | Vedoucí laboratoře |
| RNDr. Oldřich Benada, CSc. | Vedoucí vědecký pracovník |
| prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D. | Vedoucí vědecký pracovník |
| RNDr. Zdeněk Žižka, DrSc. | Vědecký pracovník |
| RNDr. Andrea Palyzová, Ph.D. | Vědecký pracovník |
| RNDr. Helena Pelantová, Ph.D. | Vědecký pracovník |
| Ing. Ludovít Škultéty, D.Sc. | Vědecký pracovník |
| Ing. Marek Kuzma, Ph.D. | Vědecký pracovník |
| Michal Grulich, Ph.D. | Vědecký pracovník |
| Ing. Jiří Novák, Ph.D. | Vědecký asistent |
| Mgr. Josef Chmelík, Ph.D. | Vědecký asistent |
| Mgr. Dominika Luptáková, Ph.D. | Vědecký asistent |
| RNDr. Tomáš Pluháček, Ph.D. | Vědecký asistent |
| Rutuja Hiraji Patil, MSc. | Vědecký asistent |
| RNDr. Helena Marešová, CSc. | Vědecký asistent |
| Mgr. Hynek Mácha | Doktorand |
| Ing. Thi Tra My Nguyenová | Doktorand |
| Mgr. Jiří Houšť | Doktorand |
| Mgr. Dominika Šindelářová | Doktorand |
| Sofía Guadalupe Zavala Meneses, MSc. | Doktorand |
| Jakub Zápal | Odborný pracovník |
| Bc. Lucie Korbová | Odborný pracovník |
| Zuzana Večerková | Odborný pracovník |
| Gabriela Lokočová | Odborný pracovník |
| Ing. Jaroslav Červený, Ph.D. | Odborný pracovník |
| Bc. Martin Sap | Odborný pracovník |
| Bc. Jan Šlauf | Odborný pracovník |
| Ing. Petr Odstrčil | Manažer a ekonom |
Naše multidisciplinární laboratoř řeší medicínsky významné problematiky metabolomickými a metalomickými přístupy zahrnujícími jak základní, tak aplikovaný výzkum. Laboratoř zahrnuje tři základní instrumentálně-analytické techniky, které jsou podporovány mikrobiologickou sekcí:
- hmotnostní spektrometrii (MS)
- spektroskopii jaderné magnetické rezonance (NMR)
- elektronovou mikroskopii (EM)
Všechny laboratorní skupiny spolupracují s řadou akademických, vysokoškolských i soukromých subjektů. Pracovníci laboratoře se podílí na vysokoškolské výuce, základní MS studijní literaturu v českém jazyce lze nalézt zde.
V rámci vědeckého směru infekční metalomiky sledujeme metalofory, toxiny a jiné mikrobiální virulenční faktory v moči či dechovém kondenzátu kriticky nemocných pacientů. Tyto molekulární značky jsou s vysokou frekvencí sekretovány patogenem do hostitele a v tělních tekutinách sledovány technikami izotopové datové filtrace. Hlavním odběratelem výsledků je mezinárodní lékařská komunita, které včasná, neinvazívní a specifická diagnostika současných významných infekčních onemocnění umožňuje bezpečně odebírat vzorky s koinfekcemi či superinfekcemi nasedajícími na primární virová onemocnění vč. covid-19.
Technika NMR metabolomiky nachází uplatnění k základnímu výzkumu chorob diabetes mellitus 2 a Alzheimerovy choroby. Více informací o řešených projektech naleznete zde. Dalšími směry výzkumu jsou fyziologie prokaryotních a eukaryotních organismů, taxonomický a funkční screening přírodních mikroorganismů orientovaný na produkci sekundárních metabolitů a biotransformace polutantů, molekulární taxonomie čistých kultur mikroorganismů, analýza mikrobiálních konsorcií, scale-up procesy a optimalizace kultivace v laboratorních bioreaktorech. Pro účely identifikace přírodních látek nejen mikrobiálního původu vyvíjíme softwarové nástroje, které zahrnují jak dereplikaci složek z komplikovaných směsí, ale i de novo strukturní stanovení nových přírodních látek se zajímavými biologickými vlastnostmi.
Více informací na webu pouze v anglickém jazyce.